Nukleotid anyagcsere
2012.11.27.
dr. Sasvári Mária
-
Szerkezet
nukleozid (adenozin, guanozin) = bázis + ribóz/dezoxiribóz
nukleotid (NMP, NDP, NTP) = bázis + ribóz/dezoxiribóz + 1 vagy 2 vagy 3 Pi
AMP = adenilát
GMP = guanilát
Nukleotid anyagcsere:
bélcsatorna: táplálék → RNS,
DNS → polinukleotidok → nukleotidok → nukleozidok → bázisok
a nukleozidok és a bázisok a véráramba kerülnek, eljutnak az extrahepatikus szövetekhez
máj:
extrahepatikus szövetek (agy, vvt, limfociták) ↔ vér
nukleozidok, bázisok kétirányú transzportja
mentő reakciók: purin bázisok kerülnek az IMP-re, AMP-re, GMP-re
Urát (húgysav): a purinbontás végterméke
a pirimidin teljesen lebomlik (CO2, H2O, NH4+)
Nukleozid/bázis analógok: legfontosabb kemoterápiás szerek (a sejtosztódást gátolják: vagy magát a nukleotid anyagcserét, vagy a
DNS/RNS szintézist) → minden osztódó sejtet gátolnak → az egészségeseket is → erős mellékhatások
Nukleozidok fontos, hogy nukleotiddá alakuljanak! A mentő reakciók nagyon fontosak!
Purin nukleotid szintézis
adeninben nincs cukor
adenozinban van cukor
a cukormentes bázisok rögtön AMP-vé alakulnak ill IMP-vé és GMP-vé
mentő reakció = egy lépés, cukor foszfátot rárakjuk (mindig ribóz)
ribóz-5-P
bázisokat mentünk meg, nem nukleozidokat, mentő reakcióban és de novo szintézisben is
aktivált forma (az 1. helyzeten pirofoszfát → itt kötődik a purinbázishoz/pirimidinhez) = foszforibozil-PP (PRPP)
lipideknél CDP, glukóznál UDP az aktivált, nukleotidoknál a ribóz-5-P
irreverzibilis reakcióban: glukóz-6-P → ribóz-5-P + NADPH
reverzibilis reakcióban: fruktóz-6-P → ribóz-5-P (transzaldoláz/transzketoláz hatására)
! Kemoterápia → dezoxiszármadékot lehet elrontani
a purin váz eredete
purin váz de novo szintézise
PRPP → hozzáadjuk a glutaminból az első N-t (közben glutamin → glutamát)
ribóz-5-P-on lógó aminocsoport = foszfo-ribozilamin ← glicin, ATP (már csak egy lépés kell az imidazol gyűrűhöz)
glicin-amid-ribozil-5-P (GAR) ← C1 formilt berakjuk
formil-(acil)-GAR (oxocsoport cseréje aminocsoportra) (közben: glutamin→glutamát)
formil-glicin-amidin-ribóz-5-P (FGAM)
gyűrű bezárása → imidazol-gyűrű –> H2O (ATP kell a gyűrűzáráshoz)
AIR (amino-imidazol-ribóz-5-P) ← CO2 (biotinos reakció)
CAIR (karboxil-amino-imidazol-ribóz-5-P) <– Asp(csak a N kell, ennek ellenére az Asp úgy donor, hogy az egész Asp-at beépítjük. gyakorlatilag szukcinát+aminocsoport)
SAICAR (szukcinil-amino-imidazol-karboxamid-ribóz-5-P) → szukcinát lehasítása, de nem adunk hozzá H-eket, ezért kettős kötés alakul ki, szukcinil csoport fumarátként hasítódik le. ADENILOSZUKCINÁZ (ASA) enzim
AICAR ← N10formil H4F (→ H4F)
FAICAR (formil-amino-imidazol-karboxamid-ribóz-5-P) → H2O elmegy, gyűzűzárás
IMP (inozit monofoszfát)
IMP AMP és GMP közötti különbség
szabályozás
purin nukleotid ciklus
IMP → → AMP → IMP → → → urát (vizelet) lebontás
a ciklus jelentősége
reverzibilis reakció: 2 ADP ↔ ATP + AMP
eltávolítjuk a végterméket (AMP-t) ezért a reakció előre fog menni (költséges reakció, de még mindig megéri az izomnak, hogy több ATP-je legyen.) ⇒ ha kevés az ATP, az AMP-kináz reakció használható ATP szint-re
energiahiányos állapotok: urát túltermelés (húgysav túltermelés. pl: fruktóz intolerancia(=fruktóz-1-P nem tud továbbalakulni → kevés energia → húgysav túltermelés)
[AMP] ↑ → → húgysav (urát) túltermelés (normális körülmények között ez visszafelé is.)
izom: magas AMP deamináz szint
erős izommunka: sokfajta tartalék felhasználása
AMP → IMP a felszabaduló ammónia a glikolízis aktivátora (anaerob glikolízis)
IMP és ammónia is a májba (a vérben magas szint)
IMP-ről a bázist leszedni → inozin → májba → → urát
urát a vérbe → vizelettel ürül
erős munkavégzés : NH3 ↑ urát ↑
izom AMP DA defektus: izomgörcs, NH3, urát NEM NŐ
purin-monofoszfát-kináz: GMP → GDP
purin-difoszfát-kináz: GDP → GTP
adenilát-kináz: AMP→ ADP
szubsztrát szintű/oxidatív foszforiláció: ADP + Pi →ATP
purin mentő reakciók
előadás!
bázis → nukleotid egy lépésben (rárakjuk a ribóz-5-P-t)
adenin → aMP (PRPP→PPi) adenil-foszforibozil-transzferáz enzim (PRT)
hipoxantin → IMP (HPRT enzim)
guanin → GMP(HPRT enzim)
HPRT hiány: Lesh-Nyhan sy.
súlyos neurológiai, pszichiátriai betegség
X-hez kötött, ritka
a gyerek harapja saját magát, az anyát mindenkit, nagyon agresszív, öncsonkítás, mentális retardáció
hyperuricemia: húgysav túltermelés
bazális ganglionok nem tudnak GTP-t szint. de novo → alacsony szint
honnan lehet észrevenni? húgysav túltermelés → kikristályosodik → kristályok a pelenkán
húgysav túltermelés → kikristályosodik → köszvény (ezek a gyerekek már nem igazán élik meg ezt a kort)
génterápiával lehet rajta segíteni
szabályozás
mindig az első lépést, a második lépést is
AMP-vel és GMP-vel (ezek a de novo szint. végtermékei)
ha mentőreakcióból → gátolják a de novo szintézist
saját maguk képződését leállítják, másik utat aktiválják (ATP akt. a GMP képződést, GTP akt. az AMP képződést)
GTP és ATP kell a másik reakcióhoz → keresztszabályozás és általános szabályozás (mentőreakcióból bejövők gátolják a saját maguk szintézisét)
de novo út intenzitása (amido-PRT aktivitás) | mentő reakció út intenzitása (HPRT aktivitás) |
máj – magas | alacsony |
vvs, baz. ggl - alacsony | magas |
A de novo út gátlószerei:
Purin nukleotidok lebontása
2012. 11. 28.
Előadó: Sasvári Márta
Lépései
Foszfát lehasítása 5'nukleotidáz hatására - ribóz 5. szénatomjáról, termékek adenozin és guanozin illetve egy foszfát lehet.
Dezaminálás vízzel - aminocsoport felszabadul, helyette oxocsoport lesz. Enzim: adenozin deamináz (ADA).
Cukor lehasítása: foszfát visszahelyezésével kezdődik, ribóz-1-foszfát keletkezik, ez nem fordul elő máshol az intermedier anyagcserében, egy enzim átalakítja.
Bázis keletkezik. Enzim: purin nukleozid foszforiláz (PNP).
Enzim deficienciák
ADA és/vagy PNP hiány - súlyos kórképek, magas adenozin koncentráció a T limfocitákra igen káros, sejtek szinte teljesen hiányoznak - „non-HIV AIDS”, súlyos, öröklődő ezért főként gyerekeket érintő immundeficiencia. Az immunrendszer nem tud megerősödni, általában tüdőgyulladás halálos kimenetelű. Mechanizmus: adenozin a vérben - relatív sok dezoxiATP keletkezik, ez a ribonukleotid reduktáz enzimet gátolja - dezoxi-ribonukleotidok nem keletkeznek, így DNS szintetizálódni és a sejtek osztódni nem tudnak. A leírt mechanizmus csak valószínűleg fedi a betegség okát.
Terápia: PEG-ADA enzimterápia, génterápia - csontvelő őssejtek kezelése
Hipoxantin (6-oxo) és guanin (2-oxo-6-amino) további eliminálása
Újrafelhasználás a mentő reakciókban
Maradék kiürítése: xantin oxidáz a hipoxantint oxidálja, közös intemedier: [2,6-dioxo]. Xantin-oxidáz flavin enzim, vízből molekuláris oxigént épít be és H2O2 keletkezik. Guanáz H2O-t beépít, NH3 felszabadul a guaninból. 2,6-dioxo-t a xantin oxidáz oxidálja - 2,6,8-trioxopurin, azaz húgysav keletkezik. Rosszul oldódik vízben, túltermelése a vérpályákban való kikristályosodást okoz.
Köszvény
Izületekben való húgysavkristályok keletkezése - irritáns, permanens gyulladás, főként a kézen és a lábon. Lesh-Nyan szindróma kísérőbetegsége.
Két formája: akut és krónikus köszvényes artritisz. Akut: időleges magas húgysavszint - fertőzés miatt sejtpusztulás, DNS lebontása szükséges, a kiváltó ok megszüntetésével elmúlik. Krónikus formája főleg időskorban.
Terápia: allopurinol - kompetitíven gátolja a hypoxantin átalakulását, hasonlít a szerkezete, xantin-oxidáz feleslegben adva inkább ezt oxidálja oxopurinollá.
Purin bázisok kiürülnek a vizelettel - hipoxantin és xantin jobban oldódik, mint a húgysav.
Hiperuricaemia okai
PRPP (aktív ribóz, prekurzor) túltermelés: stimulált de novo szintézis, túl sok purin, így sokat kell lebontani. Oka lehet genetikus: PRPP szintetáz nem gátolható mutáció miatt, vagy ribóz-5-foszfát túltermelése a PRPP felépítését stimulálja. Glu-6-foszfát szintet emelő betegségek (Von Gierke kór - glukóz-6-foszfát felhalmozódása foszfatáz-hiány miatt), mert az fru-6-foszfáttá majd ribóz-5-foszfáttá alakul. Von Gierke kór mellett a hipoglikémia mellett hiperuricaemia is tünet.
Purin mentőreakciók hiánya: - HPRT deficiencia - újrafelhasználás csökken, szintézisből származó purinok 100%-os lebontásra kerülnek.
Alcsony ATP szint, ATP metabolizmus zavara
Erős izommunka - nem kóros, időleges hiperuricaemia
Fruktóz intolerancia - fru-1-P foszfátcsapdája
Másodlagos purin többlet - nem a nulkeotid anyagcserével van probléma - szöveti károsodás, sejttörmelék kiürítése során nagy mennyiségű
DNS RNS lebontása miatt sok urát képződik.
Dezoxiribonukleotidok anyagcseréje
2'helyzetű oxigént a ribózról el kell távolítani - purin/pirimidin bázis + cukor + 2 foszfát alakú nukleotid a szubsztrátja a ribonukleotid reduktáz által katalizált reakcióknak, mind a négy féle dinukleotid szubsztrátja, külön kötő helyeken.
Két enzim SH csoport átmeneti diszulfid hidat képez, H-t átad a szubsztrátnak, egy vízmolekula kilép. Enzim tiredoxinnal (vagy glutationnal) redukálódik, ez egy prosztetikus csoport, az enzim része. Szintén prosztetikus csoport, FADH2 redukálja a tioredoxint, FAD+ NADPH+H+ oxidációja mellett redukálódik.
RR enzimszerkezet: B1 és B2 alegység - B2 tirozingyökkel rendelkezik, B1-ben két -SH csoport. 3'-n lévő H-t a tirozin gyök köti meg, ennek hatására a 2' szénatomon lévő H taszító elektrosztatikus hatás miatt leszakad, vízkilépés, diszulfidhíd, majd a két szénatom redukálása.
Szabályozás: bonyolult, mert négy szubsztrátja és négy terméke van. Fontos az arány szabályozás - a DNS polimerizálásához szükséges arányban termeljen nukleotidokat. dATP teljes allosztérikus gátlást hoz létre! Szubsztrát kötő helyek elrendeződése:
CDP - dCTP
UDP - dTTP
GDP - dGTP
ADP - dATP
Általánosan: a dATP minden keletkezést gátol, a dGTP a felette lévőket gátolja, az alatta lévő dATP keletkezését serkenti, a dTTP az alatta lévőket serkenti, a felette lévőt gátolja, a legkisebb mennyiségben keletkező dCTP-nek nincs szabályozó szerepe.
Timidilát szintáz reakció (TMP S)
dUMP-ből metilációval (5N10N-metilén-tetrahidrofilsav donor!) dTMP keletkezik, dihidrofolsav keletkezik a tetrahidrofolsavból - dihidrofolát reduktázzal tetrahidrofolát keletkezik, NADPH+H+ oxidációja mellett. Tetrahidrofolsav metiléncsoportot kaphat a szerinnel, glicinnel (+hisztidinnel, triptofánnal) való reakcióban - irreverzibilis lépés! 5N-metil-tetrahidrofolsavat az enzim felhasználni nem tudja - ezt a homociszteinnek átadva (B12 vitamin!) tetrahidrofolsavvá alakul. Ha nincs B12 vitamin (vagy folsav) - metilcsapda! Vészes vérszegénység, mert nincs sejtosztódás.
Kemoterápiás szerek támadáspontja: 5-fluoro-dUMP az enzimet gátolja, mert dTMP analóg - „öngyilkos” gátlószer, az enzimet teljesen bénítja, mert nem disszociál, vastagbélrákban alkalmazott.
Dihidrofolsav antagonistákkal, pl. metotrexáttal dihidrofolát-reduktáz enzim gátlása - DNS szintézis totális gátlása.
5-fluoro-uracillal: timin analóg, vastagbélrák kezelésére alkalmas kemoterápiás szer. 5-fluoro-uracilt a foszforiláz cukorfoszfáttal ribózt helyez a bázisra - 5-fluoro-uridin keletkezik. Enzimdeficiencia mellett a kemoterápia súlyosabb mellékahtásokat okoz!
Keletkező 5-F-UDP (TMP szintáz gátlás) és 5-F-UTP a DNS és RNS szintézist is gátol!
Folát-szintézis gátlása: ember számára vitamin, táplálékkal bevitt, de a baktériumok nem tudnak osztódni. Folsav analóg: szulfonamidok (Sumetrolim) - antibakteriális hatás.