====== Biokémia, molekuláris és sejtbiológia III. szigorlati kérdések ====== ====I. ==== - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Kapcsolt reakciók elve és jelentősége, csoportátviteli reakciók, magas csoportátviteli potenciállal rendelkező vegyületek, az ADP-ATP ciklus|A kapcsolt reakciók elve és jelentősége a bioenergetikában, csoportátviteli reakciók, csoportátviteli potenciál.]] - Oxidoredukcióban résztvevő enzimek csoportosítása és jellemzése. A dehidrogenáz típusú enzimek koenzimei. - A mitokondriális légzési lánc és az oxidatív foszforiláció. - A Szent-Györgyi-Krebs ciklus reakciólépései, jelentősége, szabályozása és feltöltése. - A piruvát-dehidrogenáz komplex és szabályozása. Az oxidatív dekarboxiláció enzimatikus mechanizmusa és koenzimei általában. - A glikolízis menete, jelentősége. A glikolízis vörösvértestben. Glikolitikus intermedierekből kiinduló szintézisek.A glikolízis regulációja májsejtekben és vázizomban. A fruktóz-2,6-biszfoszfát szerepe. - Az anaerób és aerób glikolízis energiamérlege. A redukáló ekvivalensek transzportja a citoplazmából a mitokondriumba. - A szénhidrátok szerkezete. A szénhidrátok emésztése, felszívódása és ezek zavarai. - A fruktóz anyagcseréje és annak zavarai. - A galaktóz metabolizmusa és annak zavarai. - A glukóz direkt oxidációja és a pentóz-foszfát ciklus. A Glukóz-6-foszfát-dehidrogenáz defektusa. - A vércukorszint szabályozása. Magas vércukorszint hatása a vérpályában lévő fehérjékre. - A glikogénanyagcsere enzimei és reakciói. A glikogenózisok. - A glikogénanyagcsere szabályozása a májban és a vázizomban. - A glukoneogenezis lépései, és a glukózszintézis lehetséges előnyagai. - A glikolízis-glukoneogenezis koordinált szabályozása májsejtekben. - Elágazási pontok az intermedier anyagcserében – glukóz-6-foszfát. - Elágazási pontok az intermedier anyagcserében – UDP-glukóz. - Tejsavtermelő és -felhasználó sejtek. Tejsavas acidózishoz vezető állapotok. - Trigliceridek szerkezete, emésztése és felszívódása a bélből, az exogén trigliceridek transzportja a szervezetben. - A szénhidrát-anyagcsere összefüggése a zsírsav-, illetve trigliceridszintézissel. - A NADPH szerepe, NADPH-termelő és -felhasználó reakciók. - A VLDL szerkezete, szerepe, sorsa. A szabad zsírsavak eredete és transzportja. - A zsírsejtek triglicerid-anyagcseréje és hormonális szabályozása. A foszfatidsav-származékok metabolizmusa. Foszfolipázok. - A zsírsavak oxidációja és annak szabályozása. - A ketontestek képződésének, illetve felhasználásának helye és mechanizmusa. A ketontestképződés sebességét meghatározó tényezők. A magas ketontestszinttel járó állapotok. - A zsírsavszintézis lépései, szabályozása. A zsírsavak lánchosszabbítása és a telítetlen zsírsavak szintézise. - A koleszterin szerkezete, szerepe, szintézise (szkvalénig) és a szintézis szabályozása. A koleszterin-észterek fiziológiás és patológiás szerepe; keletkezésük lehetséges helyei és módjai. - Az epesavak szerkezete, szerepe, szintézise. Az enterohepatikus körforgás. - Az eikozanoidok, illetve a szteroid hormonok szintézisének kiinduló lépései. - Az exogén és endogén koleszterin transzportja a szervezetben. Az LDL-receptor defektusa. - A máj integráló szerepe a szervezet koleszterin-anyagcseréjében. - A HDL szerepe a koleszterin-anyagcserében és kapcsolata egyéb lipoproteinekkel. - Az ateroszklerózis biokémiája. - A membrán lipidösszetétele. Membránlipidek szerkezete. ==== II.==== - Az aminosavak szerkezete és fontosabb tulajdonságai. Fehérjék szerkezete és a szerkezet helyreállításában segítő in vivo mechanizmusok. - Az enzimek mint katalizátorok, enzimaktivitás egységei. Összefüggés az enzimreakció sebessége és a szubsztrát koncentrációja között. Izoenzimek. - Reverzibilis enzimgátlások kinetikai jellemzése. Antimetabolitok. Allosztérikus szabályozás elve és példái az anyagcserében. - Enzimaktivitás szabályozása kovalens módosítás segítségével (foszforiláció és limitált proteolízis). - Mioglobin és hemoglobin szerkezete és működése. - A fehérjék emésztése a bélben, az emésztésben résztvevő proteázok, az aminosavak felszívódása. A nitrogénegyensúly és annak eltolódása. - A transzaminázok és a glutamát-dehidrogenáz szerepe az aminosavak intracelluláris lebontásában. A glutaminsav szerepe az aminosav-anyagcserében. - Az ammónia sorsa a szervezetben. A glutamin és az alanin szerepe az ammónia transzportjában. Az aszparaginsav és a glutamin mint NH2-donorok. - Az urea szintézise. Az ornitin de novo szintézisének jelentősége. Enzimopátiák. - Az oxálacetáttá, ketoglutaráttá, illetve szukcinil-KoA-vá alakuló aminosavak lebontása és annak zavarai. - A glukoplasztikus+ketoplasztikus aminosavak lebontása. A fenilalanin és tirozin lebontása és annak zavarai. - A glicin, szerin, cisztein és metionin anyagcseréje. Szintézis, lebontás, származékok, konjugált vegyületek. - C1-fragment-donor aminosavak. A fólsav szerepe, fólsav-antagonisták, támadáspontjuk. Az S- adenozil-metionin metabolizmusa és az aktivált metil ciklus. - A porfirin-váz szerkezete, bioszintézise (ennek zavarai), fontosabb porfirinvázas vegyületek. - A hem lebontása, epefestékek metabolizmusa. - A purin nukleotidok de novo szintézise és annak szabályozása. - A pirimidin nukleotidok de novo szintézise és annak szabályozása. - Nukleotidok lebontása és a purin nukleotid ciklus. - A dezoxi-ribonukleotidok szintézise. Mentő reakciók a nukleotid-anyagcserében. - Antimetabolitok a purin nukleotid-anyagcserében, a purinanyagcsere zavarai. - Elágazási pontok az intermedier anyagcserében – piruvát. - Elágazási pontok az intermedier anyagcserében – acetil-KoA. - A citokróm P450 enzimek és a mikroszomális elektron-transzfer lánc. - Biotranszformációs folyamatok általában. Konjugációs reakciók. A biotranszformációhoz kapcsolódó transzport. - Az alkohol metabolizmusa, az alkoholos májkárosodás biokémiája. - Metabolizmus és transzport: a metabolom kialakulása, az organellumok metabolikus profilja. - A mitokondrium funkciói, mitokondriális betegségek, mitokondriális DNS. - A peroxiszóma szerepe a sejt működésében. - A lizoszóma metabolikus funkciói, az organellumok pH- és redox-homeosztázisa. ==== III. ==== - Magi (szteroid-tiroid-retinoid) receptor géncsaládhoz tartozó transzkripciós faktorok. - Plazmamembrán receptorok csoportjai és működési mechanizmusuk. - Jeltovábbításban szerepet játszó GTP-kötő fehérjék csoportjai, működésük szabályozása, a legismertebb effektor fehérjék (Gs, Gi, Gt, Gq, és Ras esetében). - Szerin/treonin protein-kinázok aktiválásának ismert mechanizmusai példákkal. - A cAMP jelpálya-rendszerében résztvevő komponensek. A cAMP segítségével történő génexpresszió-szabályozás folyamata. - Foszfatidil-inozitol származékokkal működő jelpályák. - Az NFκB, illetve a TGFβ jelpályája. - A tirozinkináz receptorok szerkezete és működése, a Ras aktiválódásának mechanizmusa. - Az Erkl/Erk2 MAP kináz kaszkád felépítése és szerepe. - Az inzulin-receptorról induló jelpályák, az inzulin-rezisztencia fogalma. - Oxigén-homeosztázis szabályozása – a hipoxia jelpálya. - Az oxigén redukciója a szervezetben – oxigén tartalmú intermedierek keletkezése, káros hatásaik. - Enzimatikus és nem-enzimatikus antioxidáns védelem. - A nitrogén-monoxid szintézise, annak szabályozása, és hatásai. - A sejtciklus szabályozása: a G1 és S fázisokban. - A sejtciklus szabályozása: a G2 és M fázisokban. - A Bcl-2 fehérjék típusai és szerepük az apoptózis szabályozásában. - A kaszpázok tulajdonságai, és szerepük az apoptózis szabályozásában. - A „túlélési jel” összetevői és kapcsolata az apoptózis szabályozó fehérjéivel. - A p53 fehérje szabályozása, és aktivációjának hatásai. - Citoszkeleton felépítése. Mikrofilamentumok, aktinkötő fehérjék, mikrotubulusok. Intermedier filamentumok sejtspecifitása. Aktin citoszkeletonhoz kötött komplexek a sejt-sejt kapcsolatban. - A kontraktilis rendszer különböző típusú izmokban. A kalciumfelszabadulás és a kontraktilis fehérjék aktiválódásának mechanizmusai. A kontrakció energiaszükségletének biztosítása. - Az eukarióta sejt szerveződése. Kompartmentáció. - Organellum-biogenezis. - A fehérjeimport mechanizmusa a sejtmagban és a peroxiszómában. - A fehérjeimport mechanizmusa a lizoszómában és a mitokondriumban. - Fehérje-minőségellenőrzés az endoplazmás retikulumban, és a selejtfehérjék sorsa, ERAD. - Az organellum stressz koncepciója, Golgi stressz, peroxiszomális stressz. - Az endoplazmás retikulum stressz fogalma, a „selejtfehérje válasz” (UPR), az endoplazmás retikulum túltöltés válasz, szterinválasz. Endoplazmás retikulum stresszt okozó kórképek. - Mitokondriális stressz és mitokondriális apoptózis. - Lizoszomális stressz, lizoszomális tárolási betegségek, lizoszomotróp ágensek, lizoszomális apoptózis. - Az apoptózis fogalma és formái. Endoplazmás retikulum eredetű apoptózis és autofágia. ==== IV. ==== - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Protoonkogének és onkogének fogalma, a protoonkogének által kódolt fehérjék funkciói példákkal.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Tumorszupresszor gének fogalma, az általuk kódolt fehérjék funkciói példákkal.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A daganatsejt kialakulásához vezető genetikai módosulások.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A kollagén szerkezete, szintézise, szekréciója és ennek patológiai vonatkozásai.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az extracelluláris mátrix fehérjéi és szénhidrát komponensei. Sejt-extracelluláris mátrix kapcsolatok.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az acetil-kolin szintézise és lebontása. Kolinerg receptorok tulajdonságai.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A dopamin, noradrenalin és adrenalin szintézise. A katekolamin neurotranszmisszió.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A központi idegrendszer neurotranszmitterei, szerepük (glutamát, GABA, glicin).|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Transzporterek típusai és jellemzésük. A Na/K-ATP-áz, valamint a plazmamembrán és a szarkoplazmás retikulum Ca-ATP-áz működése.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az érfal sérülésétől a trombinaktiválásig vezető utak, azokban résztvevő mechanizmusok.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az aktív trombin szerepe a hemosztázisban. Pozitív és negatív visszacsatolások.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:K-vitaminfüggő alvadási fehérjék, a K-vitamin ciklus.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A vérlemezkék aktiválódását kiváltó ingerek és jelátviteli mechanizmusok, ezek hatása a sejt működésére.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az endotel sejtek szerepe a hemosztázis fenntartásában.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A fibrinolízis aktivációs és gátló mechanizmusai, orvosi vonatkozások.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A hemosztáziszavarok és terápiás lehetőségeik biokémiai háttere.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A prokarióta és eukarióta DNS szerkezete. A DNS-szekvencia meghatározása.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A prokarióta DNS-replikációban résztvevő fehérjék, a replikációs villa.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az eukarióta DNS replikációja. A telomeráz.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Pontmutációk. A spontán pontmutációk kialakulása. Ames próba.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A legfontosabb DNS-károsodások és repair mechanizmusok.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Transzkripció prokarióta sejtekben. A prokarióta mRNS szerkezete. A transzkripció szabályozása prokariótákban.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Transzkripció eukarióta sejtekben és az mRNS érése. Az eukarióta génexpresszió szabályozása.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az eukarióta génexpresszió befolyásolásának (a transzkripció szabályozásán kívüli) ismert mechanizmusai.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Az állati vírusok csoportosítása replikációs mechanizmusuk szerint.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Kettős szálú RNS megjelenésének szerepe az interferonok hatásmechanizmusában. DNS vírusok replikációja.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A retrovírusok replikációja. Akut transzformáló retrovírusok.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A tRNS szerepe, szerkezete, aminoacil-tRNS-szintetázok, kodon-antikodon kapcsolat.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A transzláció iniciációja prokariótákban és eukariótákban. Az eukarióta iniciáció szabályozása.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A transzláció elongációs szakasza, és terminálása. A fehérjeszintézis gátlószerei.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Poszttranszlációs módosulások. A fehérjék transzportja a sejten belül.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A fehérjeszekréciós pálya. Vezikuláris transzport, motorfehérjék szerepe.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Intracelluláris proteolízis, ubikvitináció, proteaszóma, autofagocitózis.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A DNS-klónozás lépései. Expressziós vektor fogalma.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A génkönyvtár és a cDNS-könyvtár fogalma, előállítása, összehasonlítása. Klónozás lépései.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:Polimeráz láncreakció (PCR) lényege és néhány felhasználási területe. A DNS-chip fogalma és gyakorlati alkalmazása.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A real-time PCR elve és gyakorlati alkalmazásai.|]] - [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A hosszúság-polimorfizmusok és mutációk kimutatási módszerei, ennek orvosi jelentősége.|]] - * [[aok:targyak:biokemia_molekularis_es_sejtbiologia:tetel:A csontszövet, a fogak biokémiája, a mineralizáció és a csontátépülés mechanizmusa és szabályozása.|]] (* csak FOK-os hallgatóknak) ==== V. Gyakorlati tételek ==== - A peptid-kötés kimutatása, a fehérjék mennyiségi meghatározása: a Biuret reakció. Az -SH csoportok mérése. - Fehérjék elválasztása kis molekulatömegű anyagoktól, a molekulaszűrés elve. - A papír- és vékonyréteg-kromatográfia elve, aminosavak elválasztása. - A gélelektroforézis módszere, szérumfehérjék elválasztása. A Western blot technika. - Szukcinát-dehidrogenáz kompetitív gátlása. - Mitokondriális légzés P/O hányadosának meghatározása. - ADP, malonát, atraktilozid, DNP, oligomicin, KCN hatása a mitokondriális oxigénfogyasztásra malát+glutamát, illetve szukcinát mint szubsztrát jelenlétében. - Allosztérikusan szabályozó metabolitok hatása piruvát-kináz izoenzimekre. - Tripszin tisztítása affinitás-kromatográfiával. - Szérum koleszterin és triglicerid meghatározása. - A mikroszomális drogmetabolizmus vizsgálata. - A vércukorszint meghatározása. - A Na+/K+-ATP-áz aktivitásának mérése. - A bakteriális β-galaktozidáz indukciója. - Transzaminázok és kreatin-kináz aktivitásának mérése. - Tejsav-dehidrogenáz izoenzimek vizsgálata. - Véralvadás laboratóriumi vizsgálata.