A mikrobák és az egészséges védekezőképességű szervezet háromféle kölcsnhatásban lehet:
Mikrobiotának is hívják. Körülbelül 10-szer annyi (1013) mikrobasejt él velünk, mint ahány saját sejtünk van. A CSF, hasüreg és a keringési rendszer mikrobamentes.
A normál flórában megkülönböztetünk rezidens és tranziens fajokat.
Mutuális-kommenzális viszonyban élünk a normál flóránkkal. A bőrőn és a felső légutakban a normál flóra legfőbb feladata a behatoló fertőző ágensek távoltartása.